WWW.KNIGI.KONFLIB.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

 
<< HOME
Научная библиотека
CONTACTS

Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |

«Горлачев Г.Е., Луховицкая Э.С., Скорнякова Р.Ю., Шифрин М.А. Модель данных информационной системы поддержки научноисследовательской деятельности в отделении радиологии и ...»

-- [ Страница 1 ] --

ИПМ им.М.В.Келдыша РАН • Электронная библиотека

Препринты ИПМ • Препринт № 6 за 2010 г.

Горлачев Г.Е., Луховицкая Э.С.,

Скорнякова Р.Ю., Шифрин М.А.

Модель данных

информационной системы

поддержки научноисследовательской деятельности в отделении радиологии и радиохирургии Института Нейрохирургии им. Н.Н.Бурденко РАМН Рекомендуемая форма библиографической ссылки: Модель данных информационной системы поддержки научно-исследовательской деятельности в отделении радиологии и радиохирургии Института Нейрохирургии им. Н.Н.Бурденко РАМН / Г.Е.Горлачев [и др.] // Препринты ИПМ им. М.В.Келдыша. 2010. № 6. 34 с. URL:

http://library.keldysh.ru/preprint.asp?id=2010- Аннотация Предложена объектная модель представления информации, необходимой для ведения научной работы в отделении радиологии и радиохирургии Института нейрохирургии. Основным объектом модели является пациент, а не эпизод лечения, что исключает дублирование данных для повторных больных. Данные модели представляются в виде, пригодном для компьютерного анализа: они структурированы, типизированы, а для строковых данных предусмотрены словари. Модель предусматривает также возможность дальнейшего расширения.

Abstract An object model for the information system supporting scientific investigations in the department of radiology and radiosurgery of the N.N.Burdenko Neurosurdical Institute is proposed. The main object of the model is a patient, rather than an episode of treatment, which eliminates duplication of data for repeated patients.

The model is presented in a form suitable for computer analysis: it is structured, typed, and data dictionaries are provided for string data. The model also provides capability for further expansion.

Оглавление Введение

Требования к модели

Общая объектная структура модели

Детальное описание объектов

Соответствие предлагаемой модели сформулированным требованиям

Литература

Введение Институт нейрохирургии им. Бурденко имеет давнюю историю работы с математиками. Группа математиков и врачей под руководством и по инициативе академика И.М.Гельфанда разрабатывала принципы формализации и структуризации основных медицинских данных. Работа группы велась в разных областях, в частности в области нейрохирургии [1].

Составлялись “бумажные” вопросники для решения некоторых медицинских проблем. Вопросники заполнялись врачами, данные вводились в БЭСМ-6, и на основании обработки этих данных определялись методы лечения, прогнозировались исходы заболеваний и т.д.

В наши дни повсеместное применение персональных компьютеров расширило возможности ввода и обработки медицинских данных. В Институте Нейрохирургии создан электронный вариант истории болезни – система e-med [2]. Данные о больном вводятся непосредственно в компьютер, и врачи получают многие нужные им сведения также из компьютера. В Отделении радиологии и радиохирургии работают специализированные системы LANTIS, Varis, Амфора. Однако основная задача этих систем – информационная поддержка текущего лечебного процесса. В них нет всех данных, необходимых врачу-исследователю для ведения научной работы. К тому же значительная часть данных хранится в виде неструктурированных текстов, поэтому их аналитическая компьютерная обработка весьма затруднена, а иногда и вовсе невозможна.

Мы, группа сотрудников Института нейрохирургии им. Бурденко и Института Прикладной математики им. Келдыша РАН, взялись за создание системы для Отделения радиологии и радиохирургии, ориентированной на научно-исследовательскую деятельность. Мы начали работу с того, что нам представляется наиболее актуальным для такой системы, – с концептуальной модели предметной области, логической модели данных.

Требования к модели Модель данных информационной системы для поддержки научноисследовательской деятельности в области медицины должна, по нашему мнению, удовлетворять ряду требований.

1. Модель должна быть удобна для дальнейшего расширения и модификации.

Это обязательное требование, поскольку предметная область – медицина – весьма сложна и подвержена постоянным изменениям.

Построить окончательную детальную модель для такой предметной области невозможно.

2. Модель должна исключать дублирование данных для повторных больных.

Это означает, что основным объектом модели должен быть пациент, а не эпизод лечения.

3. Данные, зависимости между которыми предполагается изучать, компьютерного анализа.

Это означает, что данные, участвующие в анализе, должны быть структурированы, типизированы, а для строковых данных, участвующих в анализе, должны быть предусмотрены словари.

Для построения модели мы используем объектно-ориентируемый подход: выделяем бизнес-объекты и описываем связи между ними. Результат мы представляем в виде UML-диаграмм [3].

Многие понятия, соответствующие основным объектам и словарям нашей модели, позаимствованы из международного терминологического классификатора SNOMED CT [4], однако есть и существенные отличия, о которых будет сказано ниже.

Термины «объект» и «класс» мы используем далее как синонимы.

Основу модели составляют следующие объекты:

Patient – пациент;

Disorder – нарушение (расстройство, заболевание);

FocusedDisease – заболевание, по поводу которого пациент проходил лечение (основной диагноз);

TimeSlot – временной промежуток;



HealthRelatedEvent – событие, связанное с состоянием здоровья пациента;

SOMAS (Space-occupying morphologically abnormal structure) – объемная морфологически аномальная структура.

Поясним введенные понятия.

Под нарушением (Disorder), так же как и в SNOMED CT, мы понимаем такое отклонение от нормы, которое предполагает развитие во времени и за которым стоит патологический процесс в организме [5].

Основное заболевание (FocusedDisease) является частным случаем нарушения (Disorder). Сопутствующие заболевания мы не выделяем отдельно, а относим непосредственно к нарушениям.

Мы не выделяем в качестве отдельных объектов точку на оси времени и временной интервал. И то, и другое мы рассматриваем как частный случай временного промежутка (TimeSlot). Кроме того мы включаем сюда и временные промежутки, начало и конец которых могут быть точно не известны, а определяются только приблизительно (т.е. начало и/или конец «размыты»).

К событиям, связанным с состоянием здоровья пациента (объектам типа HealthRelatedEvent), мы относим как события, являющиеся проявлениями состояния здоровья пациента (например, кровоизлияние, смерть пациента), так и события, повлиявшие или способные, по мнению исследователя, повлиять на состояние здоровья пациента. Эпизод лечения в такой трактовке является событием, а диагностическая процедура, если она не вызвала осложнений, – нет. Заметим, что такой подход к понятию события отличается как от подхода SNOMED CT, где лечение рассматривается только как процедура, так и от подхода медицинского стандарта HL7 [6], где к событиям относятся всевозможные действия с пациентом, производимые в процессе лечения. Отличие объясняется назначением нашей модели: она предназначена для ретроспективного анализа воздействия лечения, а также возможных других факторов на организм пациента, а не для информационной поддержки лечебного процесса. Для простоты мы объединяем в один класс единичные и множественные события. К примеру, несколько курсов химиотерапии, если каждый курс не описывается отдельно, можно рассматривать как одно событие, состоящее из нескольких эпизодов.

Объемная морфологически аномальная структура (Space-occupying morphologically abnormal structure) – это введенный нами термин, образованный из двух терминов «объемное образование» и «морфологически аномальная структура». Заболевания, которые лечат в отделении радиологии и радиохирургии ИНХ, связаны с наличием у пациента морфологически аномальных структур, которые, собственно, и подвергаются облучению.

Термин «объемное образование», который обычно используют радиологи для таких структур, соответствует в SNOMED CT термину «Mass», который там трактуется несколько уже. В частности, артериовенозные мальформации под это понятие не попадают. Термин же «морфологически аномальная структура» слишком широк, он включает в себя также аномалии на клеточном уровне, которые мы в данном случае не имеем в виду. Чтобы отличать морфологически аномальные структуры, подвергаемые облучению, от морфологически аномальных структур на клеточном уровне, мы и ввели термин «объемная морфологически аномальная структура».

Пациент, нарушение и морфологически аномальная структура рассматриваются нами в развитии. С этими объектами связаны объектысостояния Patient_Status, Disorder_Status, SOMAS_Status и объекты, представляющие динамику состояний Patient_Dynamics, Disorder_Dynamics, SOMAS_Dynamics. Как правило, это состояния непосредственно перед лечением, а также через определенные промежутки времени после лечения (результаты катамнестических осмотров и обследований).

На Рис. 1 изображена UML-диаграмма, включающая упомянутые выше объекты (классы) и связи между ними.

Рис. 1 Диаграмма основных классов модели Как видно из диаграммы, с пациентом (объектом типа Patient) связано множество временных промежутков (объектов типа TimeSlot). Мы не требуем, чтобы временные промежутки не пересекались, в частности, один из промежутков может включать в себя другой. У каждого из пациентов своя ось времени: временные промежутки, относящиеся к разным пациентам, даже если их физические временные интервалы совпадают, считаются разными. С каждым временным промежутком связано либо состояние, либо событие. В терминологии темпоральных баз данных [7] состояние – это нетерминативный факт (atelic fact), а событие – терминативный (telic fact) (перевод слов «telic» и «atelic» на русский язык взят из статьи [8]). На диаграмме связи состояний и событий с временными промежутками представлены ассоциациями TimeSlot. В тех случаях, когда важно знать, что данный временной промежуток относится ко времени до или после конкретного события, а точная временная привязка либо данного промежутка, либо события неизвестна, можно непосредственно связать временной промежуток с предшествующим или последующим событием (ассоциации Before и After). Можно также указать, что данный временной промежуток относится ко времени, когда происходило конкретное событие, например, во время курса лечения. На диаграмме эта связь представлена ассоциацией InTheCourseOf.

С пациентом Patient связаны также отмеченные за весь период наблюдения нарушения (объекты типа Disorder). Частным случаем нарушений являются основные заболевания, по поводу которых пациент проходил лечение в данном медицинском учреждении (в нашем случае в отделении радиологии) и которые составляют предмет исследования. Класс FocusedDisease, представляющий основное заболевание, является подклассом класса Disorder.

Некоторые из отмеченных нарушений можно считать симптомами основного заболевания. На диаграмме эта связь представлена ассоциацией SymptomOf.

Нарушение может быть также осложнением какого-либо события, связанного с состоянием здоровья пациента, например, лечения или кровоизлияния. На диаграмме эта связь представлена ассоциацией ComplicationOf.

Если исследователь считает, что между двумя событиями имеется причинноследственная связь, он может это отметить. На диаграмме этой связи соответствует ассоциация Cause Effect Relation.

Заболевание, по поводу которого пациент проходил лечение, может быть связано с объемной морфологически аномальной структурой (ассоциация AssociatedMAS). Исследователь может также отметить наличие у пациента других морфологически аномальных структур, не связанных с основным заболеванием, например, послеоперационной кисты.



Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |
 



Похожие работы:

«Мифы Греции и Рима Хелен Гербер 2 Книга Хелен Гербер. Мифы Греции и Рима скачана с jokibook.ru заходите, у нас всегда много свежих книг! 3 Книга Хелен Гербер. Мифы Греции и Рима скачана с jokibook.ru заходите, у нас всегда много свежих книг! Хелен Гербер Мифы Греции и Рима 4 Книга Хелен Гербер. Мифы Греции и Рима скачана с jokibook.ru заходите, у нас всегда много свежих книг! Предисловие Греческие и римские мифы вдохновили стольких писателей на создание замечательных произведений, что для их...»

«Нестандартные методы анализа А. Г. Кусраев С. С. Кутателадзе БУЛЕВОЗНАЧНЫЙ АНАЛИЗ Второе, исправленное издание Новосибирск Издательство Института математики 2003 УДК 517.11+517.98 ББК 22.16 K94 Кусраев А. Г., Кутателадзе С. С. Булевозначный анае изд., испр. Новосибирск: Изд-во Ин-та математики, лиз. 2003. xii+386 с. (Нестандартные методы анализа). ISBN 5–86134–115–X. Булевозначный анализ один из наиболее разработанных разделов, составляющих современные нестандартные методы анализа. В монографии...»

«СЛУЖЕБНОЕ РАСПИСАНИЕ ДВИЖЕНИЯ ПАССАЖИРСКИХ ПОЕЗДОВ вводится 31 мая 2009 года г. Калининград 2009г. 1 ВРЕМЯ В КНИГЕ РАСПИСАНИЙ ПОЕЗДОВ УКАЗАНО В СООТВЕТСТВИИ С УЧЕТОМ СЛЕДУЮЩИХ ВРЕМЕННЫХ ПОЯСОВ По государствам следования: Россия 0 часов Узбекистан (летнее время), Азербайджан, Таджикистан, +1 час Туркменистан Узбекистан (летнее время), +2 часа Казахстан +3 часа Беларусь, Литва, Молдова, Украина, -1 час Румыния, Болгария Венгрия, Германия, Польша, Словакия, -2 часа Чехия По дорогам следования:...»

«В.И.ПрwzенскuЙ ОПЬП ИССЛЕдОВАНИЯ МИРОВОЗЗРЕНИЯ РАННИХ РУССКИХ ЛИБЕРАЛОВ Част. I Москва 1995 ББК87.3 076 РецевиRВC iJ-ptI фшос.IIIlY'C МА.Маслuн, В. Ф.Пусmарна1С08 1IНt1ф11Аос.НilyJC А.Н А 6рам08 ПРIUIЕНСКИЙ в.и. Опыт НССЛfДОВ311Н8 076 мнровоззрснН8 pa.IНHx русских лнМралОВ. М. 1995. - 312с. ДаННaJI книга RВJIKCТCK первой частью монorpaфи­ ~ecKOГO исследоваНИR, ПОСВRщенного аНalJИЗУ миро­ воээреНИR ранних русских либералов. Кроме чисто ме­ ТОДOllOПlческИ][ ра3МЫUlllений автора об истоках, осо­...»

«1. Прогнозный анализ инфляции Сформулированная и успешно примененная автором в монографии методология прогнозного анализа используется в настоящей главе со следующими целями: Проведения анализа: • известных методов учета и классификации процессов инфляции при инвестиционном проектировании или в процессе оценки и выявление закономерностей действующих инфляционных процессов; • корректности известных из литературы и практики инвестиционного планирования и оценки методов учета инфляции; •...»

«СПИСОК РЕДКИХ И НАХОДЯЩИХСЯ ПОД УГРОЗОЙ ИСЧЕЗНОВЕНИЯ ВИДОВ (ПОДВИДОВ, ПОПУЛЯЦИЙ) ДИКИХ ЖИВОТНЫХ И ДИКОРАСТУЩИХ РАСТЕНИЙ, ГРИБОВ, ОБИТАЮЩИХ И ПРОИЗРАСТАЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ОБЛАСТИ, ЗАНОСИМЫХ В КРАСНУЮ КНИГУ НОВГОРОДСКОЙ ОБЛАСТИ 2 Русское название Латинское название ЖИВОТНЫЕ – ANIMALIA МОЛЛЮСКИ – MOLLUSCA Царство Животные – Animalia Тип Моллюски, или Мягкотелые – Mollusca Класс Двустворчатые моллюски – Bivalvia Отряд Беззубкообразные – Unioformes Семейство Жемчужницы – Margaritiferidae...»

«Об этой книге В феврале 1999 г. вышла из печати книга The McKinsey Way, написанная Итаном Расиелом – бывшим консультантом McKinsey&Company. Сочетая собственные воспоминания с рассказами других бывших сотрудников, автор описал техники, благодаря которым консультанты McKinsey помогают клиентам добиться большей эффективности, и ярко показал жизнь внутри Фирмы (так эту организацию между собой называют ее сотрудники). Основную часть книги занимало пошаговое описание консалтинга в стиле McKinsey в...»

«Рассказы, вошедшие в тома сочинений, за малым исключением, написаны в начале моего литературного пути. Семь рассказов: Встреча над Тускаророй, Эллинский Секрет, Озеро Горных Духов, Путями Старых Горняков, Олгой-Хорхой (о первом издании неточно названный Аллергорхой-Хорхой), Катти Сарк и Голец Подлунный - были написаны в 1942 - 1943 годах и увидели свет в 1944 году (кроме Эллинского Секрета, изданного лишь в 1968 году). Другие восемь рассказов: Белый Рог, Тень Минувшего, Алмазная Труба,...»

«Советская армия готовилась вести Третью мировую войну. Боевые действия включали бы в себя ядерные удары и/или традиционные маневренные действия современными подвижными бронетанковыми силами против уязвимых мест противника с целью прорыва вражеской обороны, используя массированные авиационные и артиллерийские удары с последующими действиями в тылу противника. Такой подход вполне применим к вероятным войнам будущего, однако российские военные специалисты, изучая два последних крупномасштабных...»

«ПРАВИТЕЛЬСТВО РЕСПУБЛИКИ АЛТАЙ ПОСТАНОВЛЕНИЕ от 5 декабря 2006 г. N 283 О ПЕРЕИЗДАНИИ КРАСНОЙ КНИГИ РЕСПУБЛИКИ АЛТАЙ В соответствии с пунктами 1.6, 5.2, 6.1. Положения о Красной книге Республики Алтай, утвержденного постановлением Правительства Республики Алтай от 25 января 1996 г. N 10 О Красной книге Республики Алтай, пункта 3 постановления Правительства Республики Алтай от 2 мая 2006 г. N 70 О внесении изменений в постановление Правительства Республики Алтай от 25 января 1996 г. N 10...»






 
© 2013 www.knigi.konflib.ru - «Бесплатная электронная библиотека»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.